Con el Programa de Salud Ambiental, Higiene Alimentaria y Protección Animal,  el Ayuntamiento realiza la vigilancia y control sanitario del comercio de alimentación y restauración con la finalidad de prevenir, eliminar o reducir a niveles aceptables los riesgos para la salud pública derivados del consumo de alimento. 

Se realiza, control de aguas mediante la vigilancia y control de piscinas colectivas (públicas y privadas),  análisis y control del agua de abastecimiento del municipio, con el objetivo de proteger la salud de la población de riesgos ambientales.

También realiza el control de plagas (desratización, desinfección y desinsectación), mediante la prestación del Servicio de Prevención y Control Integrado de Plagas en toda la red de saneamiento público, edificios y espacios públicos, y aquellos espacios y/o edificios bajo su competencia, en todo el término municipal de San Sebastián de los Reyes.

Protección y bienestar animal. Nos ocupamos de promover la convivencia de ciudadanos y animales, así como el control sanitario de animales domésticos, compaginando la preservación de la salud y seguridad de los vecinos de San Sebastián de los Reyes , con la protección y salvaguardia del bienestar de los animales, principalmente de compañía, con los que convivimos.